MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF3

Total Repeats: 434

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004670	TA	3	6	27	32	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004670	TAT	2	6	40	45	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004670	T	8	8	45	52	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004670	ATT	2	6	67	72	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004670	TTA	2	6	84	89	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004670	AAC	2	6	107	112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_004670	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377877
8	NC_004670	GTTTT	2	10	144	153	0 %	80 %	20 %	0 %	29377877
9	NC_004670	T	6	6	150	155	0 %	100 %	0 %	0 %	29377877
10	NC_004670	TTA	2	6	166	171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377877
11	NC_004670	A	8	8	233	240	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
12	NC_004670	CTG	2	6	299	304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29377877
13	NC_004670	TAT	2	6	326	331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377877
14	NC_004670	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
15	NC_004670	AAT	2	6	415	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377877
16	NC_004670	A	6	6	564	569	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
17	NC_004670	CAG	2	6	712	717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377877
18	NC_004670	TTAAC	2	10	785	794	40 %	40 %	0 %	20 %	29377877
19	NC_004670	AGT	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
20	NC_004670	ATG	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
21	NC_004670	GAT	2	6	946	951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
22	NC_004670	A	6	6	985	990	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
23	NC_004670	CAA	2	6	1004	1009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29377877
24	NC_004670	ACAAA	2	10	1068	1077	80 %	0 %	0 %	20 %	29377877
25	NC_004670	GCTAT	2	10	1097	1106	20 %	40 %	20 %	20 %	29377877
26	NC_004670	GTA	2	6	1165	1170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
27	NC_004670	TAAA	2	8	1196	1203	75 %	25 %	0 %	0 %	29377877
28	NC_004670	A	6	6	1201	1206	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
29	NC_004670	A	9	9	1240	1248	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
30	NC_004670	AGA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377877
31	NC_004670	A	7	7	1272	1278	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
32	NC_004670	CTT	2	6	1301	1306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377877
33	NC_004670	CTA	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377877
34	NC_004670	AAT	2	6	1430	1435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377877
35	NC_004670	AGG	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004670	CAG	2	6	1489	1494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377878
37	NC_004670	ATT	2	6	1501	1506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377878
38	NC_004670	CTA	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377878
39	NC_004670	ACG	2	6	1594	1599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377878
40	NC_004670	ACT	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377878
41	NC_004670	GAAAAA	2	12	1647	1658	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	29377878
42	NC_004670	ATT	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377878
43	NC_004670	A	6	6	1777	1782	100 %	0 %	0 %	0 %	29377878
44	NC_004670	AC	3	6	1787	1792	50 %	0 %	0 %	50 %	29377878
45	NC_004670	AGC	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377878
46	NC_004670	TGA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377878
47	NC_004670	AAT	2	6	1948	1953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377878
48	NC_004670	TTGA	2	8	1954	1961	25 %	50 %	25 %	0 %	29377878
49	NC_004670	TA	3	6	2057	2062	50 %	50 %	0 %	0 %	29377878
50	NC_004670	AAG	2	6	2075	2080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377878
51	NC_004670	CT	3	6	2084	2089	0 %	50 %	0 %	50 %	29377878
52	NC_004670	TAT	2	6	2120	2125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377878
53	NC_004670	TTTA	2	8	2171	2178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004670	TAA	3	9	2206	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004670	GAA	2	6	2228	2233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004670	AAC	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_004670	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004670	CAA	2	6	2321	2326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_004670	GA	3	6	2386	2391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004670	TAAAA	2	10	2425	2434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004670	TGA	2	6	2478	2483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004670	AT	3	6	2499	2504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004670	T	6	6	2504	2509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004670	ATT	2	6	2516	2521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004670	TA	3	6	2580	2585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004670	TTA	2	6	2589	2594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004670	TGA	2	6	2605	2610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004670	TTC	2	6	2666	2671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_004670	T	6	6	2699	2704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004670	TA	4	8	2733	2740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004670	AAAT	2	8	2779	2786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004670	A	6	6	2812	2817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004670	TAT	2	6	2828	2833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004670	TTGG	2	8	2861	2868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004670	GTTG	2	8	2901	2908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004670	CAA	2	6	2946	2951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004670	TGAG	2	8	3021	3028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004670	GAA	2	6	3034	3039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004670	AGT	3	9	3070	3078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004670	TAT	2	6	3095	3100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004670	TAA	2	6	3149	3154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004670	A	6	6	3166	3171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004670	TAA	2	6	3213	3218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004670	AAAATA	2	12	3220	3231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004670	TGTT	2	8	3282	3289	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004670	ATT	2	6	3325	3330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004670	AT	4	8	3338	3345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004670	CTT	2	6	3370	3375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_004670	TGG	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004670	A	7	7	3451	3457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004670	GAA	2	6	3553	3558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377879
92	NC_004670	TCA	2	6	3568	3573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377879
93	NC_004670	AAT	2	6	3636	3641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
94	NC_004670	TCT	2	6	3648	3653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
95	NC_004670	CTT	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
96	NC_004670	CAT	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377879
97	NC_004670	ATG	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377879
98	NC_004670	AATC	2	8	3804	3811	50 %	25 %	0 %	25 %	29377879
99	NC_004670	T	8	8	3889	3896	0 %	100 %	0 %	0 %	29377879
100	NC_004670	TGG	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29377879
101	NC_004670	A	6	6	4050	4055	100 %	0 %	0 %	0 %	29377879
102	NC_004670	TGT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377879
103	NC_004670	TCT	2	6	4171	4176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
104	NC_004670	TA	3	6	4185	4190	50 %	50 %	0 %	0 %	29377879
105	NC_004670	TAAG	2	8	4206	4213	50 %	25 %	25 %	0 %	29377879
106	NC_004670	T	7	7	4219	4225	0 %	100 %	0 %	0 %	29377879
107	NC_004670	ATA	2	6	4229	4234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
108	NC_004670	CTGTT	2	10	4269	4278	0 %	60 %	20 %	20 %	29377879
109	NC_004670	TTC	2	6	4320	4325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
110	NC_004670	ATAC	2	8	4361	4368	50 %	25 %	0 %	25 %	29377879
111	NC_004670	TCGTT	2	10	4399	4408	0 %	60 %	20 %	20 %	29377879
112	NC_004670	ATA	2	6	4503	4508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
113	NC_004670	GTTC	2	8	4537	4544	0 %	50 %	25 %	25 %	29377879
114	NC_004670	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	29377879
115	NC_004670	GTT	2	6	4603	4608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377879
116	NC_004670	AAT	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
117	NC_004670	TCC	2	6	4705	4710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_004670	TTTTAC	2	12	4767	4778	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_004670	AAT	2	6	4828	4833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004670	AAG	2	6	4919	4924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004670	AGC	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_004670	CAC	2	6	4966	4971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_004670	A	6	6	4988	4993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004670	GAG	2	6	4996	5001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004670	AGA	2	6	5010	5015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004670	AAG	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004670	A	6	6	5033	5038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004670	TGT	2	6	5049	5054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377880
129	NC_004670	GAA	2	6	5056	5061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
130	NC_004670	GAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
131	NC_004670	AGA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
132	NC_004670	AGA	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
133	NC_004670	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377880
134	NC_004670	ATA	2	6	5288	5293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
135	NC_004670	ATT	2	6	5319	5324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
136	NC_004670	A	6	6	5370	5375	100 %	0 %	0 %	0 %	29377880
137	NC_004670	ATT	2	6	5387	5392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
138	NC_004670	TGA	2	6	5394	5399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377880
139	NC_004670	CAC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29377880
140	NC_004670	A	6	6	5498	5503	100 %	0 %	0 %	0 %	29377880
141	NC_004670	T	6	6	5516	5521	0 %	100 %	0 %	0 %	29377880
142	NC_004670	ATT	2	6	5686	5691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
143	NC_004670	ATT	2	6	5749	5754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
144	NC_004670	TCC	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29377880
145	NC_004670	AAG	2	6	5867	5872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
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282	NC_004670	A	6	6	11154	11159	100 %	0 %	0 %	0 %	29377886
283	NC_004670	AAG	2	6	11162	11167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_004670	AAT	2	6	11598	11603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.